14.11.2024
Фото: ucsf.edu
Текст: Mustafin Magazine
Ученые создали быстрый геномный тест для диагностики инфекций
Тест может определить практически любой вид патогена менее чем за сутки
Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Франциско (UCSF) разработали единый геномный тест, который быстро определят почти любую инфекцию у пациента – вирусы, бактерии, грибки и паразиты. Результатами своей семилетней работы ученые поделились в научном журнале Nature Medicine.
Тест основан на методе геномного секвенирования, который называется метагеномным секвенированием нового поколения (mNGS). Вместо наблюдения симптомов для выявления диагноза у пациентов, mNGS анализирует образец спинномозговой жидкости (СМЖ) на наличие широкого спектра патогенов.
ucsf.edu
Технология mNGS проверяет все нуклеиновые кислоты, РНК и ДНК, присутствующие в образце одновременно. Затем все результаты анализов сверяются с базой данных для определения таких инфекций, как менингит, энцефалит, коронавирус, SARS-CoV-2, гепатит и многое другое.
В период с 2016 по 2023 год команда UCSF проанализировала 4828 образцов СМЖ с помощью геномного теста. Таким образом, в 14,4% образцов были выявлены патогены, а mNGS точно определил инфекцию в 86% случаев.
В исследовании есть несколько ограничений. Диагностическая работа значительно варьировалась между пациентами, что сделало невозможным прямое сравнение mNGS с другими микробиологическими методами анализа. Оно также не рассматривало клинические показания и анализ затрат и выгод теста.
Несмотря на это, ученые уверены, что этот геномный тест имеет потенциал значительно улучшить лечение неврологических инфекций, а также ускорить обнаружение новых угроз вирусной пандемии.